Protein–RNA interactions for Protein: P12270

TPR, Nucleoprotein TPR, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRP12270 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TPRP12270 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TPRP12270 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TPRP12270 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRP12270 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRP12270 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRP12270 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRP12270 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRP12270 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRP12270 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRP12270 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRP12270 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRP12270 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRP12270 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRP12270 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
TPRP12270 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms