Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GLI3P10071 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI3P10071 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI3P10071 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI3P10071 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI3P10071 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI3P10071 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI3P10071 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI3P10071 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI3P10071 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI3P10071 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI3P10071 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI3P10071 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI3P10071 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI3P10071 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GLI3P10071 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI3P10071 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI3P10071 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI3P10071 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI3P10071 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI3P10071 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI3P10071 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI3P10071 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI3P10071 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI3P10071 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI3P10071 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI3P10071 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI3P10071 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GLI3P10071 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GLI3P10071 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms