Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMIGD3P0DMS9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms