Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD63P08962 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD63P08962 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CD63P08962 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CD63P08962 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CD63P08962 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD63P08962 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD63P08962 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD63P08962 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD63P08962 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD63P08962 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD63P08962 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD63P08962 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CD63P08962 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms