Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CBX7O95931 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CBX7O95931 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CBX7O95931 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms