Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLIC3O95833 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms