Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTNSO60931 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTNSO60931 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CTNSO60931 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms