Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTSVO60911 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTSVO60911 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTSVO60911 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms