Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF3O43395 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF3O43395 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PRPF3O43395 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PRPF3O43395 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms