Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRODHO43272 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRODHO43272 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRODHO43272 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRODHO43272 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRODHO43272 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRODHO43272 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PRODHO43272 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms