Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MSH5O43196 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC007922.2-201ENST00000579049 281 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MSH5O43196 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC132192.1-201ENST00000531111 597 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC069208.1-206ENST00000538905 832 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC015878.2-201ENST00000584331 361 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MSH5O43196 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MSH5O43196 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms