Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
PHF1O43189 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
PHF1O43189 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PHF1O43189 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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