Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.431e-10■■□□□ 11.9
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PRPF4O43172 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-7■■□□□ 11.9
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PRPF4O43172 HSPA8-221ENST00000533540 1826 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.253e-6■■□□□ 11.8
PRPF4O43172 GOLGA2-204ENST00000461031 475 ntTSL 312.51□□□□□ -0.417e-9■■□□□ 11.8
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PRPF4O43172 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.491e-6■■□□□ 11.8
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