Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ANKRD28O15084 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ANKRD28O15084 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms