Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PODXLO00592 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PODXLO00592 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PODXLO00592 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PODXLO00592 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PODXLO00592 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PODXLO00592 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PODXLO00592 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PODXLO00592 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PODXLO00592 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PODXLO00592 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PODXLO00592 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PODXLO00592 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PODXLO00592 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PODXLO00592 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PODXLO00592 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PODXLO00592 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PODXLO00592 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PODXLO00592 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PODXLO00592 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PODXLO00592 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PODXLO00592 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PODXLO00592 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PODXLO00592 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PODXLO00592 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PODXLO00592 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PODXLO00592 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PODXLO00592 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PODXLO00592 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PODXLO00592 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PODXLO00592 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PODXLO00592 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PODXLO00592 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PODXLO00592 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PODXLO00592 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PODXLO00592 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms