Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
USP17L12C9JPN9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms