Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ERVV-1B6SEH8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ERVV-1B6SEH8 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms