Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HMGB1P1B2RPK0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms