Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SOBPA7XYQ1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
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