Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
C4orf47A7E2U8 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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