Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KDM2AQ9Y2K7 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KDM2AQ9Y2K7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms