Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
DTX4Q9Y2E6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DTX4Q9Y2E6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms