Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB23Q9ULC3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms