Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ98

STAG3, Cohesin subunit SA-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3Q9UJ98 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STAG3Q9UJ98 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STAG3Q9UJ98 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms