Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SFMBT1Q9UHJ3 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms