Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NKX1-2Q9UD57 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms