Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED17Q9NVC6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED17Q9NVC6 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms