Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX15Q9NRS6 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms