Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
APOBEC3GQ9HC16 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms