Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
SMIM3Q9BZL3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
SMIM3Q9BZL3 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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