Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
TRIM54Q9BYV2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
TRIM54Q9BYV2 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms