Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RSPO3Q9BXY4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms