Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SYCP2Q9BX26 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SYCP2Q9BX26 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms