Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SYT17Q9BSW7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYT17Q9BSW7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYT17Q9BSW7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SYT17Q9BSW7 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT17Q9BSW7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SYT17Q9BSW7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
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