Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
APOL4Q9BPW4 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms