Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMAD5Q99717 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms