Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RBBP8Q99708 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RBBP8Q99708 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms