Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PIK3R4Q99570 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3R4Q99570 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms