Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NAP1L3Q99457 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms