Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TSPAN18Q96SJ8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms