Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms