Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARXQ96QS3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms