Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SGCZQ96LD1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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