Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CAPZA3Q96KX2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms