Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CLPTM1LQ96KA5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms