Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RUNDC1Q96C34 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms