Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ04

LRTOMT, Transmembrane O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTOMTQ8WZ04 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRTOMTQ8WZ04 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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