Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE85

GRHL3, Grainyhead-like protein 3 homolog, humanhuman

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Length 626 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL3Q8TE85 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms