Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SEMA6DQ8NFY4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms