Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CSNK2A3Q8NEV1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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CSNK2A3Q8NEV1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CSNK2A3Q8NEV1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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